伊犁鼠兔寿命5-8年，虽然伊犁鼠兔是新发现的动物，实际上它是一种很古老的残留物种，有人认为鼠兔是由中新世晚期的跑兔进化而来。令人忧心的是，这种形状精灵的可爱小动物在现代各种因素的共同作用下，数量锐减，总体种群数量减少了64.48%以上，栖息地面积也在逐渐减少。
研究人员发现，伊犁鼠兔种群数量自2000年以来的十多年间减少55%以上，其种群的成熟个体数少于2500只，其亚种群的成熟个体数不超过250只，已经处于濒危状态。这可能是生存条件极度恶劣、自身近亲繁殖、天敌和人为干扰等原因导致的。
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