边境牧羊犬和其它宠物狗一样，每年在固定的时期就会出现发情的表现。而具体的发情时间一般在5-15天左右，平均为9天。发情的边境牧羊犬性格、生活、身体都会极大的改变。例如，发情的边牧性格会变得急躁，喜欢偷溜出户外寻找自己中意的对象等等。
在即将进入发情期的时候，边境牧羊犬的外生殖器肿胀，触诊阴唇发硬，阴道充血，阴道会排出血样分泌物，随着时间的推进，其分泌物逐渐变淡。此时的边牧还不会允许公犬进行交配，直到正式发情的时候，它才会逐渐接受公犬，并且主动与公犬进行交配。
在边境牧羊犬正式发情的第2-3天的时候，是其最佳的交配时间，而且为了是交配成功，边境牧羊犬在第一次交配后还会逐渐进行第二、第三次交配。在发情期，边牧的性格会变得更为急躁，会出现随地乱尿乱便的行为，它们以此在拓展自己的气味，以此来吸引异性的，使其前来进行交配。
严格来说，边境牧羊犬在发情的时候，情绪会变得兴奋不安，注意力不集中，而且变得涣散，同时狗狗的服从性变差，喜欢吠叫引起异性的关注，特别是在深夜的时候也会听见边牧焦急的吠叫声。发情的边牧饮水量会增大，排尿增多，食欲降低甚至拒绝饮食。由于，发情的母犬尿液中有一种外激素，甲基对羟苯甲酸，这种成分可以有效引诱公犬，因此你会发现发情的母犬喜欢随地乱尿。
