马达加斯加陆龟的交配期为10月至翌年2月，大多在11月和12月。求爱开始于雄性的嗅闻，然后环绕雌性5-30次。雄性推动雌性，有时咬雌性的头和前肢。交配时，雄性增大的外胚层穿透雌性的甲壳。雄性用它的角斑作为杠杆来推翻雌性。雌性抬起后腿以便抬起后壳。雄性会发出单个连续的声音。雄性和雌性都有多个配偶，但是每一个配偶之间间隔一定的天数。
在草原、竹林、火烧区或大草原的开阔地带交配三个月后筑巢。筑巢通常在灌木丛、原木或树木附近，通常在早晨晚些时候进行。雌性用后腿挖一个浅坑，在挖掘过程中排尿湿润土壤。平均孔宽11.43厘米，深10.92厘米。雌性将土壤紧紧包裹在蛋上，然后把它们扔了。雌龟一季可产卵4-5次，每个产卵期间隔一个月，每窝下1-6(平均3.2)个蛋，蛋球形、白色，直径约为4.19-4.7厘米、平均重量为36.2克(20-54克)。
孵化期为197-281天不等，平均237天。11月初的降雨通常会导致孵化。幼龟在白天出现，通常甲壳长度为42-46毫米，在孵化时是完全独立的。在一项为期5年的对两个种群的研究中，马达加斯加陆龟的卵受精率为71.9%，孵化成功率为54.6%。每年，一只雌性平均孵化4.3只幼龟(Pedrono等人，2001)。
