亚洲巨龟属于杂食性龟,以植物为主。大部分观念认为,亚洲巨龟在自然界中以素食为主。但在人工饲养的条件下,很大一部分龟对肉类非常热衷,且目前较为高效的饵料配比中,鱼虾肉类占了不小的比例。在育肥季节,甚至可以将荤食的比例提高到六成以上。南部产地的亚洲巨龟最容易出现只接受素食而很少接受鱼、肉类这样的情况,而中部产区的亚洲巨龟较容易出现龟对肉类的热衷程度过高的现象。
所有亚洲巨龟共同喜爱的食物就是香蕉,但香蕉并不能作为主要食物进行长期投喂,长期投喂大量香蕉的亚洲巨龟会出现大便不成形、挑食等不良反应。目前的养殖技术来看,玉米粉、红薯泥、南瓜泥是比较经典的主食底料;鱼虾就成了亚洲巨龟饵料荤食的主要成员;青料的经典食物就是红薯叶、空心菜、油麦菜、苦麻菜等。