要判断苏格兰牧羊犬是否健康，首先要看它的饮食是否正常，狗狗如果新换了环境可能会厌食，严重缺水、潜伏疾病、肠胃炎及身体有痛楚之幼犬亦会提不起胃口。这要看狗主人的仔细观察。
都说眼睛是人心灵的窗户，狗狗同样如此，眼睛明亮 眼睛的角膜是透明，让人能清楚看见眼色素层的颜色，这样的是健康的狗狗。肝炎病毒可令角膜变蓝，异物入眼或创伤可引致眼肿而紧合起来或黏膜(眼白部分)变红或角膜变白。感染狗瘟病毒及其他眼炎病原体可导致眼分泌异常多及化脓。
健康的苏格兰牧羊犬是没有鼻涕的，宠物着凉、鼻敏感或上呼吸道感染均会流鼻水。被细菌感染后，分泌物会转为奶白、黄色或绿色脓液。另外有食物从鼻孔喷出，则表示进食过急及吞咽机制有问题或有先天性结构上的缺陷。
健康的苏格兰牧羊犬身体强壮，身材适中，身体肥瘦向来都是用来衡量营养状况之传统指标。身体消瘦、体力不足，免疫力发展自然会受到影响，容易患病及康复愋慢。另外，狗只的肥瘦亦可凭腹部背面肌肉的厚度来衡量。
健康的苏格兰牧羊犬是不会咳嗽的，狗只着凉、喉咙敏感、空气环境混浊、气管炎及支气管炎均可令幼犬咳嗽。严重咳嗽加上多痰可导致胃口减低，营养欠佳。
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