首先从个体大小上可以分辨金钱龟公母,同龄时,母的金钱龟比公的大,母的背甲更饱满。可以看金钱龟的腹部,金钱龟的腹部母的是平的,公的稍微凹陷,这种构造是为了交配是公的在母的上面不易滑落。
母金钱龟尾巴细且短,公金钱龟的尾巴粗且长。可以通过尾巴来区别,但粗细是相对的。可以通过排泄孔的位置来判断公母,尾巴伸直时,金钱龟的排泄孔拉直会超出背甲边缘,而母的不会超出。
手轻轻按压金钱龟的排泄孔一会儿,松开后,母的金钱龟排泄孔会是粉色,公的会出现黑色生殖器。如果是母金钱龟的话,后部凹叉浅且宽,公金钱龟的后部凹叉深且窄。