动物机体对接种疫苗所产生的免疫应答在一定程度上受遗传因素控制，犬的品种繁多，免疫应答各有差别，即使同一品种不同个体的犬对同一疫苗的免疫应答强弱也不一致。有的犬甚至可能存在先天性免疫缺陷，从而导致免疫失调。
狗狗疫苗接种失败或是因为母源抗体干扰这是免疫失调最多见的因素之一，一定水平的母源抗体，对于保护幼犬防止早期感染传染性疾病具有极其重要的意义。但因为种犬个体免疫应答的差别，以及种犬所用疫苗的不同(所诱导的母源抗体滴度也存在较大的差别)，造成不同来源的幼犬母源抗体水平良莠不齐。要是所有幼犬均固定在相同日龄进行了首免，母源抗体太高的幼犬反而可干扰疫苗的免疫应答，而母源抗体太低的幼犬则可能在接种疫苗时处于传染病潜伏感染期，从而导致免疫失调。即使是来自同一种母犬的幼犬不同个体之间母源抗体滴度也不一定完全一致，若采用固定的首免程序，则同样会干扰疫苗的免疫应答，导致免疫失调。
狗狗疫苗接种失败或是因为营养因素抗原进入机体，产生不同水平的免疫反应——细胞免疫和体液免疫，它们都需要一定的营养物质。营养物质缺少或不足，特别是维生素A、D、B、E和多种微量元素及全价蛋白缺少时，均会影响免疫抗体的生成速度或生成的数量，从而导致免疫反应滞后或免疫应答能力下降，导致免疫失调。
