边境牧羊犬是长毛狗，容易得皮肤病，皮肤病一般由螨虫，真菌和寄生虫引起，寄生虫引起的皮肤病，现在市面上有很多治疗方法，像是福来恩滴剂、喷剂什么的都可以有效的治疗寄生虫。至于其它两种引起的皮肤病，就需要慎重对待了。
治疗螨虫最好的办法是用双甲脒，千万要注意，边牧（牧羊犬类）不能象其它狗一样的采用阿伊菌素或伊维菌素治疗螨虫，边牧使用伊维菌素或阿维菌素会中毒。真菌的治疗，首先要搞好犬皮肤构清洁卫生，经常检查被毛有无癣斑和鳞屑。加强对犬的管理，避免与病犬接触。当发现病犬要及时隔离治疗。
具体的治疗方法，可以使用灰黄霉素25—50毫克／千克体重，分2～3次内服，连服3—5周，对本病有很好的疗效。在用全身疗法的同时，患部剪毛，涂制霉菌素或多聚醛制霉菌素钠软膏，可使患犬在2～4周内痊愈。在治疗的同时，应特别注意犬舍器具、拴犬的桩柱等的消毒。2～3％氢氧化钠溶液、5～10％漂白粉溶液、1％过氧乙酸、0．5％洗必泰溶液等，都有很好的杀灭真菌的效果，可选用。
其实边境牧羊犬的皮肤病大多是饲养不周引起的，狗狗的狗窝要经常打扫，保持干净卫生，还有就是带狗狗出去玩耍的时候，不要让它去脏乱的地方，也不要和有病的狗狗接触，皮肤病的传染性很强大的。
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