巴西龟冬眠的时间大约从11月开始，等到来年的3、4月份，气温回升到18度时苏醒。冬眠时，巴西龟的头部会缩入壳中，但四肢和尾部不会。
在冬眠期间，巴西龟完全停止进食，但不会一直睡觉，它们也会偶尔活动一下。每天花上一两个小时的时间，让巴西龟晒下太阳，可以杀菌，预防疾病，让龟安全过冬。
巴西龟属于水龟，需要在水中冬眠，否则失水而死。水不用太多，刚到龟背就行。水中还需要放一块石头，提供让巴西龟休息和晒太阳的“湖中岛”。
注意室温需要保持在零度以上，不然水面会结冰，巴西龟会被冻死。但室温也不能过高，以0-10度为宜，否则巴西龟会一直爬动，无法安稳冬眠，从而造成死亡。
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巴西龟在认识主人之后，一看到主人就会欢快的在缸中游泳，并且对于主人的靠近不会躲避和抵触，巴西龟认主后还会朝主人伸长脖子要吃的。
巴西龟溺水时颈部会水肿、四肢无力，除了眼睛睁开以外，看起来没有生命特征，此时需要及时将巴西龟放在通风的地方，并按压四肢出水，期间需要喂食抗生素防止感染肺炎。
天气比较热的时候，巴西龟干养5天左右就会死，如果气候比较湿润可能会坚持得久一些，如果干养的巴西龟眼睛有凹陷说明严重脱水，必须立刻停止干养，巴西龟生病的时候可能需要干养，但也要定时泡澡。