系统繁殖是指公母双方四代或五代血系里，有一只以上的相同祖先，而且双亲及三代内，并无同一只重复出现，这样的方法就是系统繁殖法，它是一种较轻近亲繁殖，俄罗斯的高加索犬繁育者很多都采用了这种繁殖方式，因为高加索犬系统繁殖降低近亲繁殖带来的危险，有可以得到近亲繁殖的效果。
采用系统繁殖时，事先应该了解公母犬上五代至七代的血统，这是绝对的参考价值。(注：所以国外良好的血系记录体制，为高加索犬的繁殖起到了很好的作用，国内的高加索爱好者和繁育者应该做好饲养犬的血统记录。)假如准备配对的种犬祖先里，不断的出现相同的祖先，虽然在代数上不尽相同，也可以把它们作为繁殖的倾向。
一般来说，利用系统繁殖法，繁育出的优秀高加索犬的比例也相当的大，因为在繁殖时我们依据血统的记录，大约可以判断出公母犬的遗传倾向，而加以利用，祖辈的优秀特征将有很大的机会在繁育出来的高加索犬身上重现。
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