首先，从外观方面来看，大鳄龟和小鳄龟的差异是比较明显的。首先是突刺，二者的背甲上都是有突刺的，不过大鳄龟的突刺看起来比较明显，而小鳄龟的突刺不太明显，有时候甚至观察不到。再就是它们的头部，大鳄龟的头部看起来比较尖，小鳄龟的头部则是比较圆的。还有它们的尾巴，大鳄龟的尾巴比小鳄龟的要长一些。
性格区别二者的性格方面也是有差异的。大鳄龟的胆子比较小，很容易受惊，一旦有陌生人接近它们会很有敌意;小鳄龟的胆子则比较大。
在进食的时候，它们的活性也是有差异的。大鳄龟进食的时候会一直在原地不动，小鳄龟在进食的时候比较主动，会积极抢食。
价格区别大鳄龟和小鳄龟的价格也是不同的。虽然不同地方的具体价格是不同的，不过总体来看大鳄龟的价格都比小鳄龟的要高一些。
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真鳄龟公龟尾巴会比较长也比较粗，母龟的尾巴比较短小；公龟和母龟的泄殖孔位置有差异，公龟的泄殖孔距离腹甲的距离是比较远的。
野生的大鳄龟适应性是比较好的，甚至零下几度的环境中都可以生存，对高温的适应性也不错，人工养殖这种龟，最好将水温调节到最合适的范围内，28-31度之间。
人工饲养的环境下，大鳄龟的寿命一般为20~70岁左右，而在野外生存的乌龟，因为受到很多因素的影响，可能它们的寿命会减少一点。