巴西龟的公母分辨主要有三点:前爪:公的长,母的短;尾巴:公的粗长,母的短;泄殖孔:公的在肛盾外侧,母的在肛盾内侧。
通常来说,体型小的幼年龟(个体重250克以下)因性未成熟,性别难以鉴定。某些店长在出售幼年巴西龟时,说可以根据腹甲花纹来判断性别,这完全没有科学根据。同年龄的龟,雌性个体体形总是大于雄性个体。常见的巴西龟雄龟个体重达300克,雌龟个体重500克左右性成熟。其他龟类因品种不同而标准也不同。
对于常见的龟,无论水龟还是陆龟,对于其幼年龟,从体形上通常可以通过以下性别特征来鉴定其性别:雌性龟的背甲较短且宽,腹甲平坦中央无凹陷,尾细且短,尾基部细,泄殖孔距腹甲后缘较近,腹甲的2块肛盾形成的缺刻较浅,缺刻角度较大。
雄性龟的背甲较长且窄,腹甲中央略微向内陷,尾粗且长,尾基部粗,泄殖孔距腹甲后缘较远,腹甲的2块肛盾形成的缺刻较深,缺刻角度较小。