边境牧羊犬有长度适中的双层毛。小狗的毛将会变成成年狗的底毛，外层的毛将会随着小狗的长大而长出。边境牧羊犬一般不需要太多的专业美容(参赛犬例外)，主人只要能坚持每天定时的梳理就已经足够了。一天早晚两次为宜。需要的工具就是一把梳子，牧羊犬梳最好，当然别的梳子也可以，记得要从头到尾仔细地梳理，不要漏掉任何一个细节，习惯了梳毛的狗狗会认为这是一种不错的享受。梳毛的时候，如果你发现一个不顺滑的地方，用一只手抓住这个部位的毛发，另一个手拿着梳子把它顺开。最好一次少抓一点毛发，分几次梳理。如果有大面积的打结情况(屁股和尾巴部位尤其容易出现这种情况)，可使用打结毛发的切割器或刀，用尖的那面对准打结部分，将之切除。做这些事时请特别小心，因为你很容易伤到你的狗和你自己。如果碰到打结非常历害，最好带他去看专业护理人事。记得在给狗洗澡前彻底的给狗梳理。一旦它的结变湿了就会越变越紧到后来简直不可能弄开了那就只有剪掉它了。毛打结对狗来说是非常痛的特别是变得很紧的时候。
让很多主人头疼的剪指甲问题在养边境牧羊犬的人看来就不成问题，只要运动量足够，边境牧羊犬自己就会磨平指甲，不用主人费心和指甲作斗争。
边境牧羊犬洗澡不要过多，否则他们的皮毛会非常干燥。用浴盆或淋浴给狗洗澡，狗不喜欢站在脏水里而且狗都喜欢来个水按摩。狗像人一样不喜欢用冷水洗澡。别外，用温水狗会被洗得更干净。当然水温应该跟室温差不多或只稍稍热一点。如果狗在洗的时候打颤，那么水温就太冷了，如果它喘气则表示水温太热(记住，狗很容易发热所以要小心观察这些)。用专用的狗浴液可以先在盆中加水冲淡了再用毛巾或海棉给狗洗澡。记得保护好狗的耳朵，当你给耳朵冲水时。而且要用毛巾沾着清水给狗洗脸(眼周围，鼻子和嘴的部位)。我总是给狗打两次肥皂再冲两次水(你会惊奇的发现在洗第二遍的时候还有那么多的脏东西洗下来)。接下来用护毛素(如果需要的话)然后彻底冲洗。否则会有一层粘膜在狗的毛皮上那样会很容易粘上脏东西。你可以用毛巾把狗弄干，或用低温风筒吹干。不要让狗到外面去直到它完全干了为止(没什么比湿湿的毛更容易沾灰的了)。当狗干了以后还要再刷一遍。要记得在给狗洗澡前最好让它在外面清理完它的肠胃啦。当然洗澡也要在给狗喂食前完成。在洗澡时还要用很多的奖励。记住你的狗的毛皮健康是来自内部的(即适合的营养)，这是为了保证他的皮毛由内到外的闪亮和华丽。
如果狗的营养是合适的，但是毛看起来有点发暗或发干，你就要怀疑毛中有虫子或甲状腺方面的问题，你就要带他去看医生了。
