首先要准备一个建议的孵化箱，有条件的可以修建正规的孵化室。找一个干净的泡沫箱，在盖上钻两个小孔以便于透气，在里面铺一些比较粗的新蛭石，可以不用消毒，但透气性和吸水性都要好。
接下来往蛭石上加水并搅拌均匀以便于调整它的湿度，然后鳄龟蛋整齐地摆放在上面就可以了。鳄龟蛋表面的粘液要清洗干净，然后用笔轻轻地在上面标注记号，方便记录它的孵化情况以及掌握准确的孵化时间。
孵化过程中不要翻动鳄龟蛋，如果表面有水珠要擦干净，大概十天左右开箱观察一次以便于记录。孵化箱的温度不要超过30度，否则容易导致鳄龟死亡，大概60天小鳄龟就会破壳而出，要把它移居到干净的孵化箱中。
