人们时常可以看到巨头麝香龟沿着水底，徜徉在岩石、沉木和植物之间。幼体主要吃昆虫，而成体则吃螺类和蛤类，龟可以用颚部那宽阔的表面夹碎它们。
麝香龟是深水龟，但是水位需要根据麝香龟的体型大小决定深浅，设置晒背台的话，只需要将水位加到淹没麝香龟即可。但是需要保证麝香龟能将头部伸出水面，并且在换水时需要注意不能一次换水，而是需要隔天换一半水过渡。
麝香龟是深水龟，但是饲养时水位不可太深，尤其是对于幼龟而言，容易导致它们很紧张。主人需要根据麝香龟的年龄增长，适当的调整饲养麝香龟的水位，才能让麝香龟更好的成长。
