斑纹泥龟不是保护动物，斑纹泥龟受到了疾病的威胁，水也受到了采矿的污染，林业的砍伐、工业的发展、农业的开垦和下水道排出的污水等各方面的危害，斑纹泥龟的批发价格已被列出，每个在80美金以上。大量的收藏已经开始。以往很多的斑纹泥龟都是以这样的方式在这些年中不断的被买卖，所以导致了平背数量的急剧减少。阿拉巴马立法机构于1984年五月立定法案，禁止捕获和交易斑纹泥龟，对于带有商业性质交易该龟种是很好的威慑。
最初土壤的流失所导致淤泥的沉积是影响平背栖息地的主要因素，不利的影响。寻找金属物质和化学物质而开发底下土层进一步毒害了平背麝香。一份研究报告反对沉积会影响斑纹泥龟，这份研究报告同时指出栖息地已经被破坏了，指出了将严重的威胁到龟长期的生存。平背容易受化学品和下水道污染而导致贝壳被侵蚀，传染病是第二个影响的要素，失去了软体动物和无脊椎动物等食物，污染源来自于矿山排出的酸性水，农业上的化学药品、工业的废弃物和人类的生活垃圾，疾病是污染的副产品，最终的结果是影响了龟的各个方面，缓慢的生长和较底的繁殖率。
研究了近三十年显示该种类存在的时间并不长，但肯定的是已经明显的减少。多半的历史地理分布由(Mount1981,Dodd1988,Ernstetal.1989)等人指出，只有小部分以前的分布状态普遍包含该种类的健康状况。该种类的减少起初由水质和地面过快的沉降等几个因素造成。
