母犬的生殖系统由卵巢、输卵管、子宫、阴道、尿生殖前庭和阴门组成。它的主要功能是产生卵子和雌激素，并在适当的时候由卵巢释放卵子，当排卵期来临时有发情表现。
卵巢呈长而稍扁的椭圆形，完全包围于卵巢囊内，囊的腹侧面有一裂口接输卵管。表面凹凸不平，内有处于不同发育时期的卵泡，包括原始卵泡、生长卵泡和成熟卵泡。成熟卵泡在发情后3～4天成熟并破裂排卵，属自发排卵。排卵后，破裂的卵泡转为血体，然后变为共黄体。如果未妊娠，为假妊娠黄体，经一定时间而退化。如果妊娠，为妊娠黄体，持续到妊娠中期才慢慢退化。退化黄体被周围结缔组织伸入形成白体。黄体可分泌孕酮，使母犬生殖系统安静，利于妊娠。在卵巢内也有一些退化卵泡、卵闭锁卵泡，其内膜细胞可转化成间质腺细胞，能分泌雌激素。
输卵管是一较短的弯曲的细管，平均长度约5～8厘米。前端接卵巢囊，后端接子宫角，是精子和卵子受精和卵裂的部位。
母犬的子宫属双角子宫，分为子宫角、子宫体和子宫颈。子宫角细长而直，长约12～15厘米，胎儿在此生长、发育和成熟。子宫体短，长约2～3厘米。子宫颈很短，有一层厚的肌层，后连阴道。子宫借子宫阔韧带附着于腰下部和骨盆腔侧壁，位于骨盆腔入口处，在直肠和膀胱之间。子宫的形态和结构因发情周期及妊娠而有变化。在发情前期，特别是受精后，子宫内膜发生明显变化，以迎接胚胎着床，并进而形成胎盘，保护胎儿过了一段时间后，腹壁肌强烈收缩，子宫颈张开，将发育成熟的胎儿和胎衣分娩出。
犬的产道是阴道、尿生殖前庭和阴门，同时也是它的交配器官。尿生殖前庭黏膜内有前庭小腺，腹侧壁有尿道开口。阴门由左右阴唇构成，阴蒂发达。在性欲期，前庭腺功能加强发情。
母犬6月龄开始发情，到达性成熟后，每年发情2次，多在春、秋两季。但配种不应早于18月龄。从上一个发情期开始到下一个发情期开始的过程称为性周期，约126～240天，期间雌性个体生殖系统发生一系列变化，常分发情前期、发情期、发情后期和发情间期。发情期持续14～21天，母犬的外生殖器官肿胀，并有分泌物出现。一般在发情后第3天或第4天排卵，妊娠期约60天(58～63天)。
