藏鼠兔寿命5年左右,藏鼠兔头骨中等大小,颅全长不超过45mm。头骨骨嵴不发达,额骨及顶骨前部微凸,后端略平,侧观头骨背面呈弧形。鼻骨前端稍膨大,末端渐细,颧骨粗壮,向后延伸成一剑状突起,顶间骨方形或三角形,听泡鼓胀,具人字嵴与矢状嵴。两前领骨腹面仅在前端相连接,门齿孔与腭孔合并成一大孔。
藏鼠兔上门齿2对,第一对强大而弯曲,唇面具一深纵沟,第二对很细小,呈棒状,隐于第一对门齿之后。第一上前臼齿较小,其前缘具一纵沟,第二上前臼齿咀嚼面舌侧有一缺刻,内侧有2个突出棱,外侧有1个。第一上前臼齿内外侧各有2个突出棱。第一上臼齿与第三上前臼齿相似,内外侧各具2个突出棱。第二上臼齿外侧具2个突出棱,内侧有3个。下颌门齿1对。第一下前臼齿形态不规则,外侧具3个突出棱,内侧平滑无棱。第二下前臼齿及第一、第二下臼齿内、外侧各具2个突出棱,第三下臼齿较小,仅存单一齿尖。