亚洲巨龟是硬売、半水栖性的亚洲水龟中体型最大的一种。背甲长度达435毫米。成年个体重7.5千克左右，属大型龟类。成体为椭圆形，身体厚实，背部高耸、宽圆。头大，暗灰绿色至褐色，头背部眼侧、颈部有棕黄、橙色或橘红色碎小斑点。背甲棕褐色、黄褐色，中部脊棱明显，每一盾片均有同心纹理，后缘呈锯齿状;腹甲棕黄色、浅黄色，每块盾片均有清晰、呈褐色竹叶状的放射性花纹。
四肢粗壮，棕褐色，具覆瓦状大块鳞片，趾间具蹼;前肢5爪、后肢4爪，爪粗大有力。雄龟躯干长，前肢较长，性成熟的雄龟后腹部凹陷，尾部粗长，泄殖孔距腹甲后缘较远;雌龟躯干短而厚，前肢较短，腹部扁平，尾部细短，泄殖腔孔距腹甲后缘较近。
庙龟头部为黑色，侧面及眼眶处有不规则的黄色横向条纹。背甲为黑色，龟龟整体呈椭圆形，幼体后缘略呈锯齿状，随着年龄的增长逐渐钝圆化。腹甲前缘平切，后缘缺刻。四肢为灰褐色，指(趾)间具蹼，有较强的游泳能力。尾部为肉灰色，长短适中。
头较小，顶部呈黑色，体形尺寸可达50多厘米长，最大体重可以超过二十公斤，头部散布着黄色的小杂斑点，眼眶黑色有黄色碎斑点，上颌中央呈“W”型，且具有细小的锯齿。头侧部无明显纵条纹。背甲隆起较高呈黑色，腹甲黑色到黄黑交杂，个别为淡黄色，四肢灰褐色，指趾间具蹼，尾适中。雌雄鉴别：雄性腹甲中央凹陷，尾粗且长;雌性腹甲平坦，肛孔距腹甲后边缘较近，尾短。
