首先，萨摩犬都会经历初情期，初情期指的就是母犬到了特定的年纪第一次出现发情或排卵的这段时间，大概是在6-9个月大的时候。此时只要和公犬发生交配行为就能正常受孕，但不建议此时为狗狗配种，因为此时的萨摩犬虽然性成熟，但是身体发育还不完全，身体情况还无法承受怀孕所带来的压力。
萨摩犬最早可以交配繁殖的时间应该是在它正常第二次发情的时候，也就是14、15月龄的时候。在萨摩犬长大成年之后，每年还会定期发情2次，主要出现在春秋季节，也就是3-5、9-11月左右。
可以根据发情表现确定配种时间：发情初始期难以确定的萨摩耶母犬，可用试情方法确定配种最佳日期。如果萨摩耶母犬喜欢接近公犬，遇公犬时频频排尿，愿意接受公犬趴跨时;或用手按压萨摩耶母犬臀部，其尾根抬起偏向一侧，阴唇外翻频频开闭时;或是萨摩耶母犬阴道分泌物由红色变为稻草黄时，当见到上述三种表现后，1～3天即为最佳配种日期。
也可以根据外阴部变化确定配种时间：萨摩耶母犬发情后阴户有明显变化。先是阴唇横径逐渐增大，并且逐渐变的柔软。但在排卵前阴唇横径急剧缩小，接着再度增大又再度缩小，当阴唇横径每二次缩小时，即为排卵时间。在开始排卵后的48小时内，可排出80%的卵子，排出的卵子在输卵管内存活4～8天，保持受精能力4～5天。因此，阴唇横径每二次缩小后2～4天是最好的配种日期。
