深水龟和浅水龟是两种习性不同的乌龟品种。大鳄龟属于一种深水龟。野生的品种会生活在水比较深的水域中，不会对它们的身体造成危害。不过，人工养殖的品种虽然原则上来说也属于深水龟，不过水位不宜太高，水最好不要太深了。
一般来说，可以将水位高度调节到大鳄龟的背壳高度2倍左右的地方，这样的高度比较合适，可以让它们比较容易地将头探出水面呼吸。如果水非常深的话，可能会对大鳄龟造成一定的危害，因此需要避免。尤其是在大鳄龟处于龟苗时期的时候，此时它们的适应性不是太好，需要特别注意一下。随着它们的长大，体型也会慢慢变大，此时可以根据它们的体型来调节水位，合理控制水位。
即使让大鳄龟生活在深水中，也不能骤然将它们放入非常深的水中，需要逐渐升高水位才行。另外，为了让大鳄龟可以更好地将头探出水面呼吸，可以在容器中放置一些沉木、石头或者假山等物品，这样不仅观赏性好，大鳄龟还可以爬上去将头探出水面呼吸，比较方便。若是有这些物品的话，那么水可以适当深一些。
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大鳄龟鳄背甲突刺较明显，而小鳄龟背甲突刺不明显且较平；大鳄龟进食时会原地不动，而小鳄龟在进食时会主动出击；大鳄龟的胆子比小鳄龟小；大鳄龟售价高于小鳄龟。
小鳄龟腐皮可以涂红霉素或金霉素眼膏，干养五小时；擦拭碘酒或聚维碘酮消毒，然后涂金霉素或红霉素，同时可以喂抗生素；直接在水中撒黄粉。
南美拟鳄龟是水龟，这一点可以从它们的原来的分布地区看出来，它们在水中的时间是比较长的，甚至很长时间都不爬到岸上来，水龟和陆龟是习性特点差异比较大的两种乌龟。